Не знаю точно, как работает движок сайта, но возможно, зависит от количества минусов, которые комментарий успел получить до скрытия, так как скрывается он не сразу. Чем больше минусов - тем больше "уровней" скрытия, как-то так. Возможно даже, что это не запланировано, а тупо баг движка.