Она решила спасти Сю, когда она отдала ему свои нитка она весь вирус поглотила, тем самым спасла его.
P.S Конец конечно грустный, но если задуматься то в аниме было сказано что Ману можно воскресить если поместить ее душу в подходящее тело, то есть в мире аниме есть души, а значит когда Сю умрет (неважно отчего и когда) то его душа встретится с Инори можно сказать в раю, то есть он еще увидит Инори.

Надо больше спойлеров!

Хоть бы написал, что спойлер.